Identificación genética y análisis filogenético de cíclidos del estado de Tamaulipas mediante la secuenciación del Citocromo B mitocondrial
DOI:
https://doi.org/10.19136/era.a7n3.2512Palabras clave:
Gene sequencing, Herichthys carpintis, Herichthys cyanoguttatus, Mitochondrial DNA, Similitude.Resumen
El objetivo del presente estudio fue verificar genéticamente la identidad de especies del genero Herichthys y estudiar su relación fiolgenética utilizando secuencias de citocromo B mitocondrial. Se incluyeron muestras de dos sitios de Tamaulipas de dicha especie: en el río Panal ubicado en Playa Tepehuajes, Soto la Marina y en el río Carrizal ubicado en Aldama. Se analizaron las secuencias completas del gen mitocondrial citocromo B con herramientas bioinformáticas, los resultados de similitud genética indican que las muestras de Aldama tienen mayor similitud (> 99%) con la especie Herichthys carpintis. Mientras que las muestras de Tepehuajes, confirmaron la identidad supuesta con Herichthys cyanoguttatus. Los árboles filogenéticos analizados con la finalidad de comparar la distancia genética de las muestras con diferentes especies de cíclidos, confirmaron la similitud encontrada previamente. Los resultados sugieren que el citocromo B es un marcador útil en la identificación de especies de cíclidos de Tamaulipas.
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Referencias
Aguilar TMF. 2018. Crece acuacultura en Tamaulipas. Panorama Acuícola Magazine. Octubre 26, 2018. https://panoramaacuicola.com/2018/10/26/crece-acuacultura-en-tamaulipas/ Fecha de consulta: 29 de enero de 2020.
Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ (1990) Basic local alignment search tool. Journal of Molecular Biology 215: 403-410.
Artigas-Azas J M (1998) Herichthys minckleyi, part 1. Buntbarsche Bulletin 185: 16– 21.
Artigas-Azas JM (2005) La Mojarra de Tamasopo. Herichthys tamasopoensis. Cichlid News Magazine 15: 18– 25.
Baird S, Girard C (1854) Description of new species of fishes collected by John H. Clark on the V.S. and Mexican boundary survey, and in Texas, by Captain Stewart Vliet. Proceedings of Academy Natural Sciences Philadelphia 7:24–29
Berg W (2010) The Texas Cichlid Herichthys cyanoguttatus, Tropical Fish Hobbyist. Febrero.
De la Maza-Benignos M, Ornelas-García CP, de Lourdes Lozano-Vilano M, García-Ramírez ME, Doadrio I (2015) Phylogeographic analysis of genus Herichthys (Perciformes: Cichlidae), with descriptions of Nosferatu new genus and H. tepehua n. sp. Hydrobiologia 748: 201-231.
Farias IP, Ortí G, Sampaio I, Schneider H, Meyer A (2001) The cytochrome b gene as a phylogenetic marker: the limits of resolution for analyzing relationships among cichlid fishes. Journal of Molecular Evolution 53: 89-103.
Felsenstein J (1985) Confidence limits on phylogenies: An approach using the bootstrap. Evolution 39:783-791.
Heckel JJ (1840) Johann Natterer’s neue Flussfische Brasilien’s nach den Beobachtungen und Mittheilungen des Entdeckers beschrieben (Erste Abtheilung, Die Labroiden). – Annalen des Wiener Museums der Naturgeschichte, 2: 325–471.
Hulsey CD, de León FJG, Johnson YS, Hendrickson DA, Near TJ (2004) Temporal diversification of Mesoamerican cichlid fishes across a major biogeographic boundary. Molecular Phylogenetics and Evolution 31: 754-764
IUCN 2019. The IUCN Red List of Threatened Species. Version 2019-3. http://www.iucnredlist.org. Fecha de consulta: 10 de diciembre de 2019.
Jordan DS, Snyder JO (1899) Notes on a collection of fishes from the rivers of Mexico, with description of twenty new species. Bulletin of the US Fish Commission, 19:115-147.
Kumar S, Stecher G, Li M, Knyaz C, Tamura K (2018) MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms. Molecular Biology and Evolution 35:1547-1549.
Lydeard C, Roe KJ (1997) The phylogenetic utility of the mitochondrial cytochrome b gene for inferring relationships among actinopterygian fishes. Molecular Systematics of Fishes 1:285-303.
Martin AP, Bermingham E (1998) Systematics and evolution of lower Central American cichlids inferred from analysis of cytochrome b gene sequences. Molecular Phylogenetics and Evolution 9:192-203.
Miller RR, Minckley WL, Norris SM (2005) Freshwater fishes of Mexico (p. 490). Chicago and London: Museum of Zoology, University of Chicago Press.
Pepe T, Trotta M, Di Marco I, Cennamo P, Anastasio A, Cortesi ML (2005) Mitochondrial cytochrome b DNA sequence variations: an approach to fish species identification in processed fish products. Journal of Food Protection, 68: 421-425.
Pérez‐Miranda F, Mejía O, Soto‐Galera E, Espinosa‐Pérez H, Piálek L, Říčan O (2018) Phylogeny and species diversity of the genus Herichthys (Teleostei: Cichlidae). Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research 56: 223-247.
Rozewicki J, Li S, Amada KM, Standley DM, Katoh K (2019) MAFFT-DASH: integrated protein sequence and structural alignment. Nucleic Acids Research. 47:W5-W10.
Tamura K, Nei M. (1993). Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees. Molecular Biology and Evolution 10:512-526.
Taylor JN, Miller RR (1983) Cichlid fishes (genus Cichlasoma) of the Río Pánuco basin, eastern Mexico, with description of a new species (No. 59 UNI).
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