Asociación de genoma completo para el hábito de crecimiento en trigo harinero (Triticum aestivum L.)

Autores/as

  • Ana L. Gómez-Espejo Universidad Autónoma Agraria Antonio Narro
  • Carolina P. Sansaloni Centro Internacional de Mejoramiento en Maíz y Trigo (CIMMYT)
  • Juan Burgueño Centro Internacional de Mejoramiento en Maíz y Trigo (CIMMYT)
  • Fernando H. Toledo Centro Internacional de Mejoramiento en Maíz y Trigo (CIMMYT)
  • M. Humberto Reyes-Valdés Universidad Autónoma Agraria Antonio Narro

DOI:

https://doi.org/10.19136/era.a8n2.2912

Resumen

El hábito de crecimiento de los trigos harineros (primavera e invierno) está determinado primordialmente por el proceso de vernalización, regulado por los genes Vrn. Algunos estudios sugieren la implicación de otros genes en la
diferenciación de dicha característica. Por ello, se tiene por objetivo la identificación genómica de regiones con una posible relación funcional al hábito de crecimiento. Se realizó un estudio de asociación del genoma completo (GWAS) con dos enfoques de análisis: a) FarmCPU (Unificación de Probabilidad Circulante de Modelo fijo y aleatorio) y b) BLINK (Información Bayesiana y Desequilibrio de
ligamiento Anidado Iterativamente) implementados en el paquete GAPIT de R. Se utilizaron datos de 25 681 loci de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP’s) de 7 757 colectas de T. aestivum del banco de germoplasma del CIMMYT clasificadas en cuanto a su hábito de crecimiento. Se identificaron 593 marcadores SNP’s con una alta asociación al hábito de crecimiento (p < 0.01). Pero solo 70 marcadores
formaban bloques de asociación (BA) en 11 cromosomas. Como se esperaba, se identificó un BA cercano al gen Vrn1 en el cromosoma 5A. Adicionalmente se identificaron 20 regiones genómicas (BA) con asociación al hábito de crecimiento, en las que se detectó la presencia de proteínas de respuesta al estrés implicadas en procesos de aclimatación y des-aclimatación. Los resultados sugieren la participación de nuevos genes en la determinación del hábito de crecimiento en Triticum aestivum y su potencial predictivo en colectas no clasificadas.

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Publicado

2021-06-27

Número

Sección

ARTÍCULOS CIENTÍFICOS

Cómo citar

Gómez-Espejo, A. L. ., Sansaloni, C. P., Burgueño, J., Toledo, F. H., & Reyes-Valdés, M. H. (2021). Asociación de genoma completo para el hábito de crecimiento en trigo harinero (Triticum aestivum L.). Ecosistemas Y Recursos Agropecuarios, 8(2). https://doi.org/10.19136/era.a8n2.2912