Análisis filogenético de especies de Quercus L. utilizando tres códigos de barras de ADN

Filogenia en especies del género Quercus L

Autores/as

  • Flor Cristina Pacheco-Reyes Estudiante de Doctorado en Recursos Fitogenéticos para Zonas Áridas, Universidad Autónoma Agraria Antonio Narro
  • Lihua Wei Laboratorio de Biomedicina Molecular, Centro de Biotecnología Genómica, Instituto Politécnico Nacional
  • Miguel Angel Perez-Rodriguez Departamento de Botánica, Universidad Autónoma Agraria Antonio Narro

DOI:

https://doi.org/10.19136/era.a8n2.2831

Resumen

El género Quercus L., Fagaceae, es de gran relevancia en cuanto diversidad, importancia ecológica y económica; pero la información taxonómica documentada no siempre permite distinguir entre los taxones. En este estudio
se evaluó el poder discriminatorio de tres regiones de ADN (rbcL, matK e ITS2) como códigos de barras para identificar especies del género Quercus. Los datos analizados corresponden a 56 secuencias de rbcL, 51 de ITS2 y 61 de matK, provenientes de 92 especies (11 mexicanas y 81 de Eurasia y América del Norte). Los cebadores universales (rbcL e ITS2) amplificaron el 100% de las muestras de encinos mexicanos. El análisis BLAST de los fragmentos rbcL e ITS2 de encinos mexicanos, proporcionó un poder de identificación alto con 98.1 y 98.3%, respectivamente. Con el método basado en la distancia genética se tuvieron tasas de discriminación extremadamente bajas, posiblemente debido a distancias genéticas superpuestas, además de la frecuente hibridación entre especies y la baja tasa de variación. El método de unión de vecinos cercanos proporcionó un poder discriminatorio alto con los marcadores matK (81.96%) e ITS2 (80.39%), generando agrupaciones por regiones geográficas y por secciones del subgénero Quercus en los arboles filogenéticos. Según el rendimiento general de dicho método se propone el uso de ITS2 y matK como los códigos de barras de ADN más adecuados para la identificación de especies del género Quercus.

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Publicado

2021-06-25

Cómo citar

Pacheco-Reyes, F. C. ., Wei, L. ., & Perez-Rodriguez, M. A. (2021). Análisis filogenético de especies de Quercus L. utilizando tres códigos de barras de ADN: Filogenia en especies del género Quercus L. Ecosistemas Y Recursos Agropecuarios, 8(2). https://doi.org/10.19136/era.a8n2.2831

Número

Sección

ARTÍCULOS CIENTÍFICOS